有機棉GOTS/OCS審核包括文件審核還有生產(chǎn)現(xiàn)場的審核，來確定，制定的文件是否與實際的現(xiàn)場相符合，有沒有正確實施。現(xiàn)場檢查是評估有機管理體系有效性的重要途徑。其次還要通過對加工管理人員，車間員工，操作者的訪談來驗證申請者提供的文件記錄等是不是有機操作中真正的得到實施。
對于GOTS認證項目，還要對*低社會標準進行審核，如種族歧視，自由結(jié)社，體罰，強迫勞動，童工，工資工時等進行審查。
對于OCS,包含兩個認證等級OCS100和OCS Blended,前者要求至少含有95%的有機原料，后者要求至少含有5%的有機原料，可與其他任何纖維原料混合。
1）產(chǎn)品的取樣：
在現(xiàn)場檢查過程中，檢查員必須考慮產(chǎn)品的取樣問題，根據(jù)標準的要求，如有對有機操作有任何懷疑，可以取樣，并填寫取樣文件。
2） 檢查范圍：
對于申請的產(chǎn)品涉及到得所以加工工序及設(shè)施進行審核，需要在非加工現(xiàn)場分裝貼標簽等也要對這些場所進行檢查，以*保*認證產(chǎn)品的完整性。
3）文件：
確認其對有機生產(chǎn)的風險及申請者采取措施的有限性，是否存在平行生產(chǎn)，有機與非有機生產(chǎn)隔離措施的有效性。
4）污染物排放和能源管理（注意哦：GOTS/GRS認證有要求，OCS不要求）：
對于GOTS/GRS標準還需關(guān)注其污染物的排放是否符合要求，例如重金屬，溫度，PH,COD等；對于能源方面 ，需要關(guān)注是否建立了節(jié)能減排的政策和持續(xù)改進計劃并實施 。
5）人員
對于OCS標準需要通過對生產(chǎn)者至少管理人員，質(zhì)量負責人，工人，倉管負責人的訪談；而GOTS/GRS認證標準還需要訪問財務(wù)，衛(wèi)生，消防，工會人員以及其他相關(guān)人員如污染物處理人員等的訪談，判斷申請者對有機標準的理解，有機管理體系的掌握與實施，有機生產(chǎn)的加工與標準的符合性等，對工人的訪問是單獨的訪問，避開所屬領(lǐng)導，便于工人能夠提供真實詳細的信息，訪問人員不低于3人。
6）投入物的審核：
對于OCS標準主要關(guān)注有機成分的比例，但對于GOTS標準，還需要關(guān)注在生產(chǎn)過程中助劑和添加劑的使用，尤其是涉及到印染工藝的，需要重點關(guān)注使用的印染料和其它化工產(chǎn)品是否符合要求。
7）檢查中其它需要注意的內(nèi)容：
對認證產(chǎn)品的產(chǎn)量與銷售量的匯總核算。
對產(chǎn)品和認證認證標志追溯體系，包裝標志的情況和驗證。
對上一年度的不符合項采取的糾正或糾正措施進行驗證。